Oldukça sık yapılan bu cerrahi işlemin komplikasyon oranı % 2'ye kadar çıkabilmektedir. Rapor edilenler arasında kanama, infeksiyon, frenulum ülseri, penil yapışıklıklar, uzun kalmış sünnet derisi, uretral fistül, tetanoz ve methemoglobinemi bulunmaktadır. Bunlar ve benzeri istenmeyen durumlarla karşılaşma riskini en aza indirmenin yolu, sünnetin genel anestezi altında ve uzman doktor tarafından yapılmasıdır.